第1集
秦兵押送途中，大毛晕倒，村夫小子荆天明仗义喂水，被官兵呵斥。天明不服，却被鞭子抽晕过去。待天明在暴雨中醒来，却发现周围血流成河，官兵尸首遍地。望着此情此景，天明不知发生何事。赢政看密报，得知当年刺杀自己的荆轲之子尚在人间。十三年前，秦王妃子丽姬以死换取她和荆轲的孩子一命。如今找到这个叫荆天明的孩子，必当斩草除根。殊不知赢政身边的红人，天下第一剑客盖聂，正是受荆轲所托，潜伏在赢政身边的人。如今知晓赢政要除掉天明，连夜快马赶出咸阳城，前去保护荆天明。盖聂的一举一动，全在墨家监视中。盖聂一出城，墨家消息网就在全国传开消息，被东皇太子藏匿多年的荆天明出现了。荆天明一回到村里，村长就说他杀了官兵，带他去官府自首，否则全村老小死路一条。天明只知从小到大，一直有个神秘女孩在保护他，却不知是谁。其实是听命于东皇太一的少司命。盖聂抢在赢政的亲兵到来之前，把天明救出来，天明不知盖聂为何人，想逃走。墨家医仙端木蓉一直认为荆轲为盖聂所害，大骂他在秦王身边当了十三年的走狗。
第2集
荆天明欲和项家翩翩公子项少羽单挑，却根本不是对手，被项家关押在柴房。秦王得知盖聂把孩子救走，暴怒。端木蓉在项府找到天明和盖聂的关押处，欲相救，却被项少羽发现。这时秦王派来的重兵包围项府。项氏以为端木蓉是奸细，把他们一家出卖给一直想剿灭他们的秦王。秦兵杀进项府，混战中项家寡不敌众，和背着盖聂的天明，端木蓉一起被官兵围住。这时墨家首领东郭植带人赶到，杀退官兵。张良断后，摆下八卦慑心阵，让官兵无法近身。墨家首领东郭植对美貌泼辣的端木蓉一向爱慕有加，总想引起她的注意，端木蓉却总是对他恶语相向。张良欲撮合墨家与项家合作，一起对抗秦王。月夜之下，墨家早已安排好船只前来接应。荆天明和项少羽同时被站在船头温柔婉约的姑娘迷住，原来她就是墨家巨子的女儿高月。项家一众被带到墨家休养生息之地——墨家guǐ • cūn，隐匿于绝岭雄峰之间，集结了墨家深厚的智慧，是天下所有反秦势力最后的堡垒。guǐ • cūn口就有张良布下的奇门遁甲之术，外人如若贸然闯入，就会迷路找不到出口。
第3集
盖聂不肯说出当年真相，端木蓉怀恨在心以残忍的手段为他疗伤。天明讨好心上人却被高月施针麻痹了身体，他只能眼看着少羽向高月大献殷勤。少羽在高月面前力邀天明比武，天明武功不济却使诈夺胜。盖聂病况稍有起色，天明拜师却被他拒绝。剑圣盖聂的风姿动人，医仙端木蓉芳心萌动。杀手易容成勇叔欲掳走天明，此时勇叔尸体被人发现，天明侥幸逃过一劫。
第4集
guǐ • cūn不断有人离奇死亡，少羽和天明跟踪发现铃儿和假勇叔私会。端木蓉怀疑盖聂是凶手遂欲对他狠下杀手，天明和少羽及时赶来阻止。铃儿谋害高月被当场揭穿，原来她是杀手蛊娘，蛊娘和guǐ • cūn众人大战最终败退。秦兵围剿guǐ • cūn，项氏一族助墨家迎敌。卫庄被收买杀死盖聂，然而二人相见却牵出一段纠葛。盖聂和卫庄曾是七杀门的人，卫庄为救盖聂埋身火海并从此对盖聂心怀仇恨。
第5集
盖聂被卫庄打败，而天明忽然被邪术控制大开杀戒。天明自幼身怀异能且由阴阳家云中君教导，盖聂希望端木蓉消除天明的异能。众人否认卫庄曾经出现，天明误以为被邪术控制只是梦境。项氏一族不愿遵从墨家号令单独离开，少羽独自留在墨家。东郭植和天明等人到洛阳后受到巨富金万两热情接待，并被安排住进雪女掌管的妃雪阁，随后天明等人惊悉金万两就是墨家巨子。高渐离通过雪女的乐师考核，雪女其实早年便倾慕他的才华。第6集
卫庄揭穿东皇太一就是中车府令赵高，原来赵高系羲氏一族，当年赵国与秦军一战大败，羲氏一族被赵王怪罪占卜不利而遭灭族，赵高为复兴羲氏而潜伏在秦王身边。为了抢床睡，不懂武功的天明竟与少羽打成平手。少羽将天明曾发狂之事告之，并对天明异能进行测试，谁知竟令天明误打误撞找到了操控异能的方法。
第7集
少羽装扮成女人和天明一起教训算命骗子，却不想反而引来官兵的追捕。天明控制不了力量而晕倒，少司命救了天明，却对天明心念高月感到不悦。少司命将天明送回原处，高月用她莫名的灵力救天明醒来。盖聂虽将天明是荆轲之子的身世告诉天明，但他无法说出荆轲是死于自己手中。端木蓉为天明去除邪力，恢复正常的天明感到失落。
第8集
雪女为她的舞蹈表演向洛阳城内的达官贵族散发请柬，连平时不愿露面的雁春君也大驾光临。高渐离在雪女舞蹈表演时行刺雁春君，但被雪女看穿化解危机。高渐离与盖聂相遇，高渐离将雁春君就是当年出卖七杀门的叛徒告诉盖聂。雪女偷偷来见盖聂，原来她也曾是七杀门的人，雪女曾经爱慕七杀门长老高渐离。高渐离劝说雪女帮他复仇，但雪女表示七杀门是她最大的噩梦，她拒绝报仇。
第9集
盖聂拒绝复兴七杀门，高渐离深感失望。雁春君收下了雪女的拜贴，雪女和高渐离来到雁春君府见到的却是卫庄。卫庄杀了雁春君，他回忆起当年继承了死门的职位，并被当年是鲍长老的雁春君利用害死了掌门，他记恨高渐离当年只救了盖聂，没有救困在火场的自己。高渐离向卫庄道歉，但他并不后悔自己的选择。天明和少羽等人来到染坊，岂料危险很快来袭。
第10集
染坊被易夫子布下阵法，端木蓉火烧阵法救了天明等人。端木蓉意外解开天明身上的咒印释放出了邪力，天明的身体却无法承受邪力濒临崩溃，端木蓉束手无策非常自责。高渐离不告而别，雪女随之远走天涯希望能够找到他。少羽驾驭墨家班大师改造的马车，岂料结局极其惨烈。盖聂在巨子和端木蓉的面前说出荆轲刺秦的真相，他和荆轲本是意气相投的兄弟，而荆轲死于他的剑下也另有内情。荆轲留下遗书希望秦国一统后选定贤良之人统治天下，盖聂认为扶苏就是贤良之人。端木蓉难以压抑对盖聂的好感，东郭植为失恋而痛心不已。天明总是做着同一个噩梦，梦见父亲荆轲刺秦却死在盖聂的剑下。天明把心事告诉高月，高月将父亲鞠玄和太子丹策划荆轲刺秦一事娓娓道来，而刺秦失败也让鞠玄和太子丹受牵连被追杀而亡。
第12集
聂答应教天明剑法却不打算收他为徒，天明为此愤愤不平，然而端木蓉看出盖聂此举是为了方便日后天明为父报仇。端木蓉和盖聂彼此钟情，然而未能宣诸于口的情感让二人颇受折磨。盖聂制作剑谱交给天明后不告而别，端木蓉追随而去却在途中被卫庄擒获。盖聂和卫庄自小结义却因命运捉弄而互相为敌，他们即将一战。赤练在比武结束后偷袭，端木蓉为救盖聂中毒。
第13集
盖聂挥剑向赤练逼讨解药，岂料天纵奇才的端木蓉已经施针为自己解毒。卫庄救了遭遇灭门之祸的赤练和白凤，并将他们培养成杀手，而赤练也在成长的过程中对卫庄交付痴心。盖聂说出离开的原因，他不想端木蓉将来在他与天明之间的恩怨中为难。高渐离沉浸在痛苦中无法自拔，雪女在屋外吹萧，高渐离这才发现以前曾经与他琴萧合奏的女子就是雪女。
第14集
天明在与月儿外出时再度晕倒，在梦里天明的身体分裂成善与恶，天明被告知父亲被盖聂所杀的真相，月儿再度用她的灵力让天明平静下来。赤练和白凤去杀盖聂，盖聂将其制服却仍旧放两人离去。大司命和少司命出现在天明面前，大司命以寻找盖聂杀荆轲真相为借口骗天明去咸阳。天明答应随大司命去咸阳，月儿发现天明的反常后阻止天明离去却未果。
第15集
天明一夜未眠，最终决定跟随大司命去咸阳，自己找出真相。月儿一路追赶天明来到了后山，被大司命用火墙挡住。天明担心月儿，却被大司命手刀击晕，交给少司命带往咸阳。听见大司命说要带天明去咸阳，月儿担心天明的安危，辞别少羽和班大师，一路快马加鞭，终于赶在马车之前找到了江边的巨子。月儿向巨子汇报天明被阴阳家的人带走，巨子怕天明卷入阴谋，安排小植和高月找韩信帮忙解救。天明询问扶苏，当年是否是盖聂杀了荆轲，得到了扶苏的肯定。但是，扶苏认为盖聂是个侠义之人，这么做必定另有隐情。天明询问公子扶苏对盖聂的看法，扶苏告诉他，盖聂心怀侠义行事磊落，是个难得的君子，自己之所以能够打消顾虑与巨子相谈，一方面是因为对墨家理念的认同，更重要的原因则是出于对盖聂的信任。少司命被东皇太一处以鞭刑，大司命心中疼惜无比，却不敢表现出来。月神与大司命一向不合，在看出大司命对少司命的喜爱后，三番五次的用语言刺激他，却反被其嘲笑“身为月神，却干着侍女的活”。盖聂等人回到了终南别馆，得知天明失踪，众人都非常担心。急性子的蓉儿立刻就要前去咸阳寻天明，恰好在门外见到小植带着天明和月儿回来。再次相聚，大家都很高兴，唯独天明对盖聂心存芥蒂，一直闷闷不乐。
第17集
蓉儿给天明诊脉，发现天明的病情恶化了很多，又奇怪他去咸阳做什么。询问月儿后得知天明已经知道荆轲是被盖聂所杀，受了阴阳家的蛊惑，所以才去了咸阳。经过月儿的提醒，蓉儿推测天明病情的恶化可能跟情绪有关。扶苏将巨子视作知音，命心腹去金府，将宫中的剿杀令传信给巨子。韩信得知秦王的计谋后，与家老用太平树的联络方式找到了巨子。巨子几次运功，想用内里将毒素逼出，却都以失败告终。月儿分析了最近发生的事情，推测商社被剿的事情与天明有关。为了不影响对天明的治疗，月儿叮嘱少羽不要告诉他。
第18集
少羽询问月儿对天明的格外关心，是不是因为心里在乎天明。月儿被说中心事，连忙借口医者仁心做掩饰。看穿了月儿的掩饰，又想到自己对月儿的在乎，少羽心中更加酸楚。面对天明的疑问，盖聂只说了是巨子的决定后，便一言不发。天明告诉盖聂，大家对他的隐瞒并不是保护，而是不信任。当年鞠玄（巨子）护送太子丹逃离燕国失败，为了躲避通缉，不给妻女引来祸端，鞠玄加入了墨家，之后更名换姓成为了墨家的首领巨子。为了墨家的事业，巨子无暇关心自己妻女。墨家发展壮大以后，巨子去找妻儿，却发现原本的家已经被烧毁，废墟之中找到了妻子碧华的一个盒子。巨子对自己这些年来的不管不问十分自责，于是跑去挖妻儿的坟墓，想把他们安葬在一个山清水秀的地方，永远陪着自己。
第19集