虽然如此，但佛郎机人依然还是以“可能威胁到马尼拉港口安全”为由，拒绝放这三条商船入港，只让另外没有武装的四条商船，进入了马尼拉港。
用了四天的时间，将四条商船上的货物，卸载到码头上后，又用了五天的时间，将另外三条船上的货物，也转运到了码头上。
总共用了九天的时间，才将所有的货物卸载完毕。
之后，四条没有武装的商船，又在马尼拉，用了一个半月的时间，采买了将近三百万的货物后，然后才跟马尼拉的佛郎机人商船队，一起离开了马尼拉。
在离开马尼拉港口后，那三条被马尼拉的佛郎机人的舰队，严密监视着的‘武装’商船，才跟船队重新汇合在了一起。
在返回杭州的途中，在琼州府以南的海域里，由皇家商号七条商船和马尼拉的佛郎机人的十三条商船组成的船队，又遇上了郑家另外一支更加庞大的船队。
由郑家老二，福州水师参将郑芝虎率领的，直接连郑家黑色飞龙旗都没挂，就挂着大明福州水师参将旗号的郑家舰队，已经打着剿灭海盗的旗号，在南海海域搜索游荡了一个多月了！
由一百三十七条大小舰船组成的庞大的舰队，几乎将福州水师参将、漳州水师游击以及兴化水师游击三支郑家在福建所掌握的舰船，全都抽调了出来！
漳州水师游击郑芝豹以及兴化水师游击郑芝凤，在南海巡防的时候，遭遇海盗，全军覆没的消息，在一个月前，就已经传到了福州。
得到消息后，福州水师参将郑芝虎当场被气得晕死了过去。仅仅只隔了一天，郑芝虎便带着福州水师参将所属的所有舰船，南下剿匪，在经过漳州和兴化的时候，将郑芝豹、郑芝凤留下的船只，也一并的带了出去。
之前郑芝豹、郑芝凤去南海巡防的时候，打着的是郑家的黑色飞龙旗，所有人都知道，那是郑家在海上，以海商（海盗）的身份活动的时候，打的旗号，根本不是官府的旗号。
虽然出事之后，郑芝虎还是以“南海巡防，遭遇海盗”的名义，向朝廷进行了汇报，并且替郑芝豹和郑芝凤，向朝廷请抚，朝廷在接到郑芝虎的奏报后，也毫不吝惜的，追授郑芝豹和郑芝凤，福建水师总兵和参将的官衔。
但是，打着黑色飞龙旗出海，在海上被人黑吃黑给吃了，郑芝虎也只能哑巴吃黄连，有苦说不出！
而这一次，郑芝虎可就聪明多了，连飞龙旗都不打，直接打着官府的旗号，南下剿匪，这样一来，再遇上刘香的时候，那可就完全可以正大光明的开打了！
从得到的消息来看，郑芝豹他们在南海，完全就是上了刘香的当，被刘香设下了包围圈，才导致郑芝豹、郑芝凤两兄弟被杀，郑家船队全军覆没的。
因此，这一次南下，郑芝虎完全就是冲着刘香去的！
而打着官府旗号的郑芝虎的舰队，在遇上大明皇家商号和佛郎机人的商船队的时候，也保持了相对的冷静，并没有做出什么出格的事情来。
不过，在看到郑家这么大的一支舰队，出现在南海的时候，佛郎机人商船的领队尼古拉丁·弗朗茨，依然还是感到手脚发麻，心跳加速。
虽然尼古拉丁率领的这十三条商船，都拥有十几门，甚至是二三十门火炮的强大的自卫能力，但是在面对郑家多达一百多条战舰的时候，尼古拉丁依然还是没有任何跟郑家一战的勇气和决心。