朱成功见了郑联，大喜，正找不着汝，汝竟自己送上门来了。
立即命人解除了郑联等人的武装，控制起来。
又安慰道：“兄长勿惊，吾此来只是替兄长整饬军纪，绝无伤兄长性命之意”。
一开始朱成功真没有杀郑联的意思，但架不住郑芝莞、施郎等人在耳边说，郑联的部下有两万多人，你才一万多人，不杀郑联，那两万多降兵，没法控制。
左劝右劝，朱成功下了狠心，决定杀郑联以除后患。
毕竟是自己从兄，杀之前，朱成功请郑联吃了顿饭。
中秋节后一天，他邀郑联当晚到虎溪岩赴宴。
郑联不知死期已到，他是好酒之人，喝酒的兴致非常高。一边喝，还一边和朱成功回忆小时候的事。郑联比朱成功大十岁，可以说看着朱成功长大。聊起朱成功小时候的事，不由得开心得呵呵大笑。
朱成功越喝越难受。一个人要想伤害另一个和自己有血缘关系的人，尤其是这个人还是看见自己长大的人，心里难免是不舒服的。
他推辞不胜酒力，离开了酒宴。
郑联犹未察觉，又喝了许久，直喝得醉醺醺的，方才散场。他往自己的驻地万石岩走去，走到一座石门旁，伏兵四起（《厦门志》载：“沿涧上行至一石门，镌‘锁云’二字，即郑成功刺郑联处也”）。
郑联大惊，慌乱间想逃。四面八方皆是伏兵，又如何逃得掉？
一刀捅入了他的腹部，一刀砍中他的肩胛，一刀又一刀??
郑联倒在血泊中，口唇翕张，喃喃自语：“大木，汝好狠毒！”
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杀了郑联，朱成功顺利兼并了郑联的部下，军队一下子增长到四万人。
他又派人拿着自己的亲笔信和折箭，去连江请郑彩回厦门，信誓旦旦地表示只要郑彩回厦门，绝不伤其性命。
为了养活这数万大军，朱成功下令设立商行，陆路五行负责采购丝绸、瓷器等物资，海路五行负责将这些商品贩往日本、朝鲜售卖。
厦门城内，又一家郑氏商行结彩营业了。
对面粮行的佘掌柜，去商行逛了逛，说了几句“恭祝财运亨通”的话后，立即回屋写信。
写完信，叫上店里的伙计兼部下，“快，汝速将此信送交锦衣卫指挥同知马吉翔处”。
很快地，一份关于朱成功的人员、军队、经济等各方面的情报就送到了朱亨嘉的御案上。
朱亨嘉看完，倒吸一口凉气，“这个朱成功，够狠，连自己的从兄都杀！现在又广开海贸。海贸之利，何止千万。若任其发展下去，将来必定会割据福建，尾大不掉”。
不能再等了，朱亨嘉下令平虏大将军严天凤立即从广东进攻福建，又令降将耿继茂、惠之观部，增援严天凤。
又令福建巡抚袁彭年，加大力度，招降郑彩。
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