先后派遣了李实、杨善前往，终于把上皇接了回来，这是于谦的功劳。
太上皇已经回来，瓦剌请求朝贡，先前贡使不过百人，正统十三年增加到三千余人，对给予的赏赐不满足便入侵。
此次瓦剌又派三千人来朝，于谦请求列兵居庸关以备不测，在京师隆重陈兵，设宴招待。
因此说到和议很难依靠，逐条进上安定边境的三个策略，请求敕令大同、宣府、永平、山海、辽东各路总兵官增修墙准备防御。
京兵分别隶属于五军营、神机营、三千营，虽然各设有总兵，但不相统一，请求选择精锐十五万人，分为十营团操，从此开始了团营的制度。
瓦剌入贡，常常携带以前掳去的人口来，于谦一定奏请酬劳使者，前后赎回了几百人。
当初永乐年中，投降过来的人被安置在京畿附近的很多，也先入侵时，很多成了内应。
于谦想分散遣送他们，因为西南有战事，每次出征，都挑选他们精锐的骑手，从厚资助他们前往西南战场，然后再遣送他们的妻子，内患得以平定。
杨洪以独石入卫，八个城都给了敌人，于谦使都督孙安率轻骑兵出龙门关占据了它，招募百姓屯田，边战边守，八个城得以收复。
贵州苗未平定，何文渊建议撤去布使、按察两司，专设都指挥使司，用大将镇守，于谦说：
“不设两个司，是放弃了这地方。”
建议遂作罢，于谦认为上皇虽然回来了，但国耻未洗雪，正值也先和脱脱不花结怨，请求趁机派大军，自己前往征讨他，以报复从前的仇恨，清除边患，明代宗不准。
于谦主持兵部工作时，也先的势力正在扩张，而福建邓茂七、浙江叶宗留、广东黄萧养各自拥有部众和自封的封号，湖广、贵州、广西、瑶、侗、苗、僚到处蜂起作乱，前后的军队征集调遣，都是于谦独自安排。
当战事匆忙急迫，瞬息万变的时候，于谦眼睛看着手指数着，随口讲述奏章，全都能按照机宜采取正确的方针方法。
同事和下属接受命令，彼此看着都感到惊骇佩服，号令严明，虽然是勋臣老将稍有不守法度，立即请圣旨切实责备。
一张小字条送到万里外，没有不谨慎小心执行的，他才思的畅通敏捷，考虑的周到仔细，一时没有人能比得上。