虽说金木研在那之后销声匿迹了一段时间，但食种，毕竟还是食种，哪怕他能隐藏一时，也隐藏不了一世。毕竟他们的心中，可是潜藏着一头头暴戾无比地怪物的……
于“青铜树”事件发生半年后再次登场，并且在期间制造了惊动喰种界的“七区喰种餐厅”事件。因为大量的共喰加上不停的锻炼，使得金木的实力得到飞速提升。
在了解了一系列关于“青铜树”组织的消息后，为了进一步接近事情的真相和了解自己成为喰种的缘由，与月山习和万丈数一等捕获了A女士并前往将自己改造为“喰种”的嘉纳医生的居住地进行调查，途中遭遇了安久黑奈与安久奈白姐妹的阻碍并与同伴分开行动。
与月山，数一等人分头后，金木再次遇到了青铜树的人——原6区首领，从食尸鬼关押区逃出的SS级喰种“鯱”（神代叉荣），并与之进行战斗，因实力差距使得金木被击败。
随后突遇嘉纳医生，心中突激起各种感情的金木想要把嘉纳医生带走，却被嘉纳医生放出的大量不成品的半人半食尸鬼“实验体”困住，战斗中将所有实验体吞噬并成为了“半赫者”。
之后遭遇CCG喰种搜查官并展开战斗，半赫化带来的威力狂暴无比，连作战经验丰富的特等搜查官篠原幸纪都被其完全压制，最终亚门钢太朗与铃屋什造同时加入才得以击败暴走的金木。但由于双方都伤亡惨重，战斗就此终止。此战斗中金木被CCG定级为“SS级喰种”。篠原幸纪在战斗中对金木的评价是“在我所见过的喰种中，你是最疯狂的一个”。
嘉娜医生事件调查未果的金木选择了前往古董咖啡店向芳村店长询问更多关于“青铜树”组织的信息，随后从店长口中得知青铜树组织成立的契机是因为芳村店长的孩子“独眼的枭”。
了解更多信息并进行了大量思想斗争的金木最终决定带领自己的小队重新回到“古董”咖啡厅，然而此时的金木并不知道，古董已被CCG喰种搜查官组织悄然盯上，并展开了大规模针对芳村店长的“枭”讨伐计划。在讨伐当天从大屏幕看到现场情况的金木震惊不已。
由于店长是SSS级喰种，因此此次讨伐规模异常庞大；为不让自己的同伴陷入危险，金木决定独自一人孤身前往现场协助古董作战；月山习得知后欲用武力阻止金木前往，称“那个规模，就算是整个月山家出动也是以卵击石”，却被下定决心的金木瞬间制服后放弃阻止。
到达现场后展开战斗姿态的金木一击破坏了准特等搜查官钵川忠的库因克并使其彻底丧失战斗力，拯救了差点被杀死的古董成员入见萱（黑狗）并将其安置。随后金木一人在众搜查官分队中穿梭自如并破坏了众多搜查官的库因克，使其失去战斗能力后继续前进。过程中再次救下了险些丧命的古董成员古间圆儿（魔猿），并仅以一击破坏了特等搜查官田中丸望元的库因克。
安置完古董同伴的金木研决定顺势一口气前往芳村店长的战斗阵地。途中再次与亚门钢太朗相遇，并再次暴走成为半赫者。意识错乱中斩断了亚门的一只胳膊，自己亦受重伤。危机时好友永近英良现身在金木面前并表示想要帮助金木，让金木吃了自己，待金木恢复理智后永近已经不知去向而且自身的伤势已经愈合。
恢复伤势后的金木前往与古间和入见约定好的地点集合，但站在集合地点的却是CCG的死神——不败的喰种搜查官有马贵将，金木欲与之战斗，但实力差距过于悬殊，被有马的库因克打穿脑部，两眼皆被击穿。
受伤倒地意识恍惚的金木回忆起一切的开端，神代利世事故的当天，有一位“道化师”（小丑面具的喰种），站在事故的现场，行为诡异略显可疑。
最终话中，金木的档案已被CCG消去，显示为“驱逐成功”。
在枭驱逐战之后金木失去了记忆，头发之后也变成了黑白双色，有马贵将给金木取了佐佐木琲世的新名字，而ccg总议长和修常吉让金木带领库因克斯班（QS班）的瓜江久生、不知吟士、六月透和米林才子。
在成为搜查官一段时间后获得了白单翼奖（单独驱逐s级喰种才会获得的奖项）。对于那时的”佐佐木“来说有马贵将则是自己的父亲，而真户晓则是自己的母亲一般。
”佐佐木“同样喜欢看书，并且还将自己的书借给有马。而已经成为准特等的铃屋什造认出了”佐佐木“为金木，将偷走的金木的钱包还给了他，每次见面”佐佐木“都会在口袋里面准备食物给什造，而什造也十分关心金木。
同时佐佐木常常会在精神世界中遇到”白金木“，但却很抵触其的力量，不愿接受其的力量。
佐佐木前往喰种收容所与神父多奈托·普鲁普拉见面得到了神父的建议帮助，并且神父还邀请”佐佐木“下一次见面商谈重要的事情。瓜江久生和不知吟士及六月透抓捕torso之时遭遇大蛇，佐佐木赶到救了他们。与大蛇交手，先被贯穿肚子，让部下原地待机再次调整状态后将大蛇贯穿身体击败。佐佐木揭开大蛇的面具后发现其真实身份是西尾锦，西尾锦说出金木研的名字使得佐佐木暴走，被平子丈班制服并带回CCG，之后佐佐木撤销瓜江久生班长的身份，让不知吟士接任班长。
在外出喝咖啡时再遇雾岛董香，但由于失忆此时并未认出董香。后又见到了四方莲示。在喝完董香的咖啡后情不自禁流下眼泪，并发觉了董香虽在微笑着，但有着些许的哀伤。后佐佐木在心里暗想”原来有这样美丽的人存在啊“。
拍卖会扫荡战展开，QS班同玲屋班组队。在“拍卖会清缴战”中与瓜江一起击溃叶·冯·罗斯华尔德，救下六月透。后和不知吟士，米林才子在遭遇被改造为独眼喰种的泷泽政道后执行和修政的命令留下来独自应对泷泽政道，不知与才子则去和一等搜查官林村同去对战胡桃夹子。佐佐木在与泷泽政道的战斗中被对方完全碾压，之后被政道喊出了其”金木研“的名字，佐佐木陷入混乱，而此时精神世界中再度出现“白金木”。佐佐木认识到，如果自己不接受“白金木”的力量，自己就可能会被杀，而一旦接受，自己“佐佐木琲世”这个人格就可能会消失，之后被笛口雏实救下。但雏实不敌泷泽。期间”佐佐木“由于失忆并不认识雏实，但从雏实拼死保护自己的行为上看出雏实是曾经的自己——”金木研“认识的人。最后佐佐木劝雏实离开，并称自己“尽管身体是金木研，但我是佐佐木琲世”，但随后又表示“被人如此怀念的金木，一定是个很棒的人吧”，之后不顾雏实和才子的阻止要再去对决泷泽政道，并称“就算我消失也没关系，请给我守护的力量”。