除了废相、撤中书省，洪武帝还借着胡惟庸案对朝廷体制进行了更加大刀阔斧的改革。
左御史大夫陈宁、御史中丞涂节参与谋反。洪武帝宣布裁撤御史台，改置都察院。从“台”到“院”，御史台的最gāo • guān员由从一品左御史大夫降为了正二品左都御史。
朝廷六部尚书皆为正二品。这样一来，文官系统之中再无一品官员。正一品、从一品自此成为了追谥的品级。大明文官活着的时候无人可以荣膺一品。这是为了削弱文官的力量。
这日，洪武帝在乾清宫内召见了外甥李文忠。李文忠如今是大都督府左都督，名义上的明军最高统帅。
洪武帝见到李文忠，先说道：“你与朕同去坤宁宫看看皇后吧。”
李文忠是马皇后一手拉扯大的，马皇后将他视如己出。来到坤宁宫在病榻前见到马皇后，李文忠这个硬汉不禁潸然泪下：“皇后娘娘，一月未见，您怎么连床都下不来了。”
马皇后挤出一丝笑容：“忠儿，你一个统领千军万马的大都督，怎么哭哭啼啼作小女儿状？”
李文忠跪倒在马皇后面前：“文忠心里难受。”
马皇后道：“忠儿，你在朝中好好做官，好好带兵，好好辅助圣上和太子。也不枉本宫辛辛苦苦将你抚养大。”
李文忠跪地叩首：“是，忠儿记住了！忠儿一定尽心竭力，辅佐圣上和太子。”
马皇后又问：“景隆怎么样了？”
李文忠有一子，名叫李景隆。今年已然十一岁。
李文忠答道：“景隆已经开了蒙，这几日外甥正在教他《孙子兵法》。”
洪武帝却在一旁道：“上次朕去曹国公府，你那儿子在朕面前大谈兵法云云，呵，还颇有几分少年统帅的风采呢。不过兵法还是要付诸于实践，不然就是纸上谈兵。你看徐达家的徐辉祖，就是跟着他爹在战场上拼杀出了带兵打仗的真本事。如今已是一省都司了。”
洪武帝一语成谶，数十年后，李景隆成了纸上谈兵的统帅。在靖难之役中昏招频频，直接导致了南军的失败。自然这些都是后话。
探望完马皇后，洪武帝对李文忠说：“陪朕出去走走。”
李文忠毕恭毕敬的跟在洪武帝身后，在坤宁宫的青石台阶上散步。
洪武帝忽然说道：“有件事朕很发愁啊。”