三、从系统配置文件中寻找
在有些系统配置文件中也可以找到自启动程序的踪迹，如、、、和等。
四、通过“系统配置实用程序”寻找
在“开始→运行”中键入“”启动“系统配置实用程序”，进入“启动”选项卡，即可查看随系统启动的程序名称和位置。
注意：Win2000本身没有Msconfig程序，可以从WinXP/2003中提取。
五、从计划任务中寻找
在“控制面板”中双击“任务计划”就可以查看是否有计划任务随系统一起启动。
六、使用“系统信息”寻找
进入“系统信息”主界面，依次展开分支“软件环境→启动程序”，就可以在右窗格中查看自启动程序名称和位置。
七、使用“组策略”寻找
在Win2000/XP/2003中，在“开始→运行”中键入“”，打开“组策略”，依次展开“用户配置→管理模板→系统→登录/注销”，双击“在用户登录时运行这些程序”，单击“显示”按钮，即可查看自启动程序。
八、通过注册表寻找
在注册表中，可以从下列键值中查找自启动程序的名称和位置。
键
位于“HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\WindowsNT\CurrentVersion\Winlogon\Userinit”。这个键允许指定用逗号分隔的多个程序。
\Run键
位于“HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Policies\Explorer\Run”和“HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Policies\Explorer\Run”。
键
RunServicesOnce键用来启动服务程序，在用户登录之前启动，具体位置是“HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\RunServicesOnce”和“HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\RunServicesOnce”。
键
RunServices键指定的程序在RunServicesOnce指定的程序之后运行，不过仍在用户登录之前。具体位置是：“HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\RunServices”和“HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\RunServices”。
键
Run是自动运行程序最常用的键，位置在“HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Run”和“HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Run”。
键
位于“HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\WindowsNT\CurrentVersion\Windows\load”。
另外还有RunOnce、RunOnce\Setup等键。