10月25日华中局、新四军领导机关全部入鲁，中共中央华东局正式成
立。华中分局与华中军区亦成立。
12月3日中央军委决定新四军军部兼山东军区领导机关。陈毅军长兼山东军区司令员。
1946年45岁
1月7日津浦前线指挥部撤销，组成山东野战军（简称山野），陈任司令员兼政委。下辖第一、第二纵队，第七、第八师。其时国民党军约10万人
由徐州向鲁南枣庄、峄县（今峄城）一线进犯，山野于11日开始反击，国民党军缩据韩庄、贾汪一线。
l月9日国民党新编第六路军由其总司令郝鹏举率领举行反内战起义，改编为“华中民主联军”。陈多次前往训话。
l月13日国、共双方在1月10日签订的停战协议本日起生效。
1月23日向飞抵峄县的军事调处执行部徐州小组提出国民党军违令的材料，要求查处。
2月2日与飞抵临沂的军事调处执行部济南小组晤谈执行第二号命令事。
2月11日在临沂西关文庙向党政军领导机关干部传达中共中央2月1日
《关于目前形势和任务》的指示，指出练兵、减租、生产是目前解放区三项中心工作，部队要通过练兵达到正规化。
2月23日华东局颁发了《百日练兵军政工作指示》。
3月2日至3日三人委员会周恩来、张治中、马歇尔由北平飞抵济南，陈往迎接，并一同飞往徐州。其间详谈了国民党军诸多违令事件及处理办法。
3月7日山东党政军领导机关在临沂集会庆祝叶挺将军出狱，陈到会讲话，并致电慰问，促请其返回新四军。
4月12日得悉叶挺等于4月8日殉难，作《哭叶军长希夷同志》悼诗志哀。19
日在临沂举行追悼会，陈号召“继承四·八烈士遗志，为革命奋斗”。
5月在华东局高干会议上作《关于如何正确执行中央“五·四”指示的报告》。
6月在临沂接见由青岛飞来的美海军陆战队的克莱门将军，向他揭露了国民党在美国的支持下，正准备发动全面内战的阴谋。
6月7日至16日在山东境内胜利地进行了津浦路、胶济路讨逆战役，歼伪军3万余人，解放德州等城镇数座。
6月22日中央军委鉴于国民党军大举进攻在即，拟定了外线出击以粉碎国民党军的内战阴谋的作战方针。陈毅表示坚决拥护。
6月26日包围中原解放区的国民党军开始大举进攻，中原解放军胜利突围，全面内战爆发，解放战争开始。
6月28日至29日到新安镇附近会晤中共华中分局领导人邓子恢、张鼎丞，研究作战方针。
7月1日中共华东局发布迎击国民党军大举进攻的紧急动员令。
7月14日在前方指挥所干部会上作《如何取得战争的胜利》的报告。
7月18日徐州国民党军以17万余人开始向淮北、鲁南解放区进攻。山野积极准备迎敌。7月24日，对第八师营以上干部作出击华中的动员。
7月27日至29日进行朝阳集战斗，歼国民党军第九十二旅等部5000余人。
8月7日至9日围攻泗阳未克，淮北战场情势紧张，山野陷于被动。
7月13日至8月27日苏中战役七战七捷。
9月7日到华中分局与邓子恢、张鼎丞会商9、10两月在淮北作战问题。
9月19日撤出淮阴、海安。
9月23日中央军委指示合并山东、华中两个野战军指挥部，陈为司令员兼政委。
9月28日报告中央军委：“陈已来华野，即以华野为统一指挥机关。宋时轮、唐亮率山野指挥部进驻沐阳以北，负责指挥七、八两师、滨海警备旅??
华中分局移淮海区主持，陈士榘任军部参谋长，即在临沂主持工作。”
10月19日至30日涟水保卫战，歼敌整编第七十四师一部，掩护华中后方向山东转移。
10月27日在华中军区直属队干部会议上作《华东三个月自卫战争的总结和今后任务》的报告。
11月上旬在涟水西北陈师庵召开团以上干部会议，进一步讲清形势任务与要求。
11月10日对进攻鲁南解放区的国民党军发动句（儿庄）枣（庄）路反击战。1
月11日延安《解放日报》报道华东部队开展立功运动的消息，“号召普遍响应立功运动”。
12月1日朱德生日，在八师连以上干部大会上介绍总司令的生平和时事问题，号召八师连续打歼灭战。
12月9日率一纵、八师自鲁南南下，待粟裕等到达后，于13
日至19日胜利地进行了宿北战役，歼国民党整编第六十九师等部万余人，中央军委传令嘉奖一切有功将士。此后，华东战局转趋主动。
12月25日山东、华中两野战军合并。
1947年46岁
1月2日至20日鲁南战役获胜，歼蒋军5万余人。
1月下旬华东全军实行统一整编，撤销山东、华中两野战军番号，正式组成华东野战军（简称华野），下辖12个纵队，陈为司令员兼政委，并成立
中共华东野战军前委，陈为前委书记。
在临沂附近召开的前委扩大会议上作“一面打仗、一面建设”的报告。中央军委对此颇为赞许。
2月6日对1月27日叛变之郝鹏举部实行讨伐，至7日黄昏，歼叛军两个师，生俘郝鹏举。
2月20日至23日莱芜战役获胜，歼蒋军万余人，解放了胶济线13个城镇。
3月前委扩大会议在淄川大矿地举行，传达贯彻中共中央关于《迎接中国革命的新高潮》的指示。陈毅总结8个月作战经验，布置休整，准备迎击
国民党军新的进攻。
3月下旬国民党集中了24个整编师、60个旅，共45万人，开始对山东实施重点进攻。
4月下旬实施蒙泰战役，于22日攻克泰安，歼国民党军整编第七十二师等部。
5月13日至16日孟良崮战役，歼国民党精锐主力整编第七十四师等部
万人。
5月28日至6月2日野战军在沂水西北之坡庄召开团以上干部会议作孟
良崮战役总结，陈作形势任务报告。
6月底第一、三、四、八、十纵队分兵向敌后出击，连克数城。但自7月下半月以后，由于雨季作战，洪水横流，各路攻击均未得手，部队减员甚
众。为争取主动，指挥部北渡黄河。
8月29日前委发布《野