盐税：依太祖旧制，每斤盐抽税二十二文。朱亨嘉令户部派员去广西、粤西、琼州各地清查盐政。大明朝盐税理论上能收一千多万两，但实际收一百万两都难。朱亨嘉表示不服，非派人清查不可。
其二、废除矿禁
除金、银、铜等战略性矿产外，允许民间采矿。矿税，也就是坑冶之课，按十分之二征收。
令户部派官，勘探矿产，开拓财源。
其三、筹建大明钱庄
令户部派官，联合民间各大钱庄，筹建大明钱庄，也就是未来的大明中央银行。只有有了中央银行，下一步铸钱、印钞，施行起来才方便。
其四、铸钱印钞
令户部联合各大钱庄，筹备铸靖江通宝。当然，现在只是筹备，铸钱印钞的事不能急，急了容易出乱子。治大国如烹小鲜，朱亨嘉觉得稳一点好。
其五、新修水利
令工部督水、屯田二司，在各地修建水渠、堤坝等水利设施。
其六、奖励耕织
朱亨嘉亲自颁布劝农诏令，令礼部、户部下发各地；令钦天监修订农历、国子监翻译各国农书并普及；令户部统计好农政和户口，引进番薯等高产作物，鼓励民众恳荒，荒田归开垦者所有；又令各地表彰种田高手、织布巾帼，敲锣打鼓、骑马夸街。
其七、鼓励兴办实业
鼓励钱庄借贷给实业主纺织、造船等。新办实业三年免税，三年后按盈利的十分之一征收实业税。大明朝已经出现资本主义萌芽，朱亨嘉很想薅一把资本家的羊毛。
三，军事方面
其一、申明军纪
颁布军规十八条。又下令：将官士卒，有擅夺百姓一物者，立刻取斩；如该主不首，连坐；该管官失察，责八十棍。立法若是之严，史载凡发兵征剿，所过大路，鸡犬不惊，百姓卖酒肉者路旁不断。民得安息反富庶焉。
就连反对靖藩谋逆最坚决的封建大儒也称赞道：“靖逆立法甚严，兵民相安。”
其二、奖励军功、抚恤伤亡、授爵授田
朱亨嘉取消了斩首级记功政策，改为了镇抚官登记记功。回桂林后，朱亨嘉根据各级将士战功，将没收的部分叛乱土司土地授予立功将士，少则十亩、二十亩，多则几百、上千亩。
阵亡将士赐家属良田百亩；残疾将士赐良田五十亩。
其余参战人员亦赐银二两。军心大悦。
又授杨国威为兴业侯、史其文为平南侯、范友贤为定北侯、李明忠为定西伯、严遵诰为武勇伯、杨武为安南伯、孙贵为定海伯、杨怀为忠勇伯、朱亨跨为镇国将军。
严天凤本来和杨国威、史其文、范友贤同为伯爵，但严天凤在肇庆驻守未参战立功，其他三人都因战功升了侯爵。朱亨嘉怕严天凤心里失落，将自己的女儿永福县主朱慧研（九岁）许给了严天凤的小儿子严孝勇（十二岁）。“坐在监囯的位置上，考虑问题必须全面呀！”朱亨嘉想。
其三、严格训练
令各部不分战兵、守兵，日夕操练，三、六、九为大操。
其四、加强军工生产
将兵部由武选、职方、车驾、武库四司扩建为武选、职方、车驾、武库、武备五司。
新设的武备司设郎中（正五品）一人、员外郎（从五品）两人、主事（正六品）若干，专门负责军工生产。下设战马科、火器科、兵甲科、军需科、舰船科，各设主事负责。朱亨嘉让他们制定制度，重奖发明创造；又让他们在保持质量的基础上，既可以自行生产，也可以下订单给民间。
其五、扩建海军
令在廉州合浦、琼州儋州、高州电白、安南兴安修建军港、水寨。
以刘贵为广东水师总兵，领水兵一万五千并各类大小战船四百九十二艘，驻守合浦；令田虎为儋州水营守备，领兵一千并各类战船五十艘；令钱亮为电白水营守备，领水兵一千并各类战船五十艘；令王治囯为兴安水营守备，领水兵六百并各类战船三十艘。