徐有贞进言说：
“不杀于谦，复辟这件事就成了出师无名。”
明英宗的主意便拿定了，正月二十三日，于谦被押往崇文门外，就在这座他曾拼死保卫的城池前，得到了他最后的结局——斩决。
史载：天下冤之！遂溪的教谕吾豫说于谦的罪应该灭族，于谦所推荐的各文武大臣都应该处死。
刑部坚持原判这才停止了，千户白琦又请求写上他的罪行，刻板印刷在全国公布。
政治上，于谦敢于为民请命，严惩作奸犯科权贵，而受到排挤打击。
人家当官前呼后拥，尽显官威，于谦当官便服一套，瘦马一匹，同僚并不以其为谦虚清廉，却说他坏了官场规矩。
军事上，于谦主张兵贵在精，将贵谋勇，用兵贵在临机应变，提倡“将士相习”，“管军者知军士之强弱，为兵者知将帅之号令”，所创团营之制，对明朝兵制影响很大。
文学上，于谦诗作归隐情怀的表达与慷慨悲凉的风貌预示了诗坛风气的转向。
在台阁体流行的高峰期，文人们是忌讳表达激烈的情怀与悲伤的情感的，从而保持了其创作风格的雍容，以便发挥其鸣盛的政治作用。
思想上，于谦重名节，轻名利，重成仁，轻杀身，重社稷，轻君王。
于谦一生都在家里恭恭敬敬地供奉文天祥的遗像和牌位，就像供奉自己于家的祖先一样，甚至比供奉自家的祖先还要虔诚。